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BOIN设计-如何获得试验设计参数

发布时间:2021-12-21 文章来源:本站  浏览次数:6519

前言

上一期我们从理论和实际例子角度介绍了BOIN设计在临床研究中的作用,以及其相对于传统3+3设计的优势。本期,我们简要介绍如何借助各种软件来计算获得我们使用BOIN作为临床试验设计过程中需要的参数以及其他数据。

方法一

使用线上BOIN设计网站(适合非专业用户)

要获得设计参数以及相关的数据,首选使用安德森癌症研究中心推出的线上的BOIN suite网站。网址为https://trialdesign.org/one-page-shell.html#BOIN,下面我们简要的介绍如何进行操作:

1.Trial Setting选项卡

(1)首先我们可以利用Trial Setting选项卡填写剂量组数目起始剂量级别每队列人数总队列人数单剂量组最大入组人数这几个基础参数,这些数据应通过前期对药物本身毒性及特性的了解进行选择。


(2)下一步即可设定目标毒性概率,应综合考虑药物毒性及收益风险关系。如果药物在低剂量组下被认为是安全的,可以选择使用加速滴定的设计。如果选择的队列人数为3和6的话,也可以选择合并使用3+3设计,这样可以与传统设计更加契合,并且保留了BOIN设计的优势。


(3)最后则是设置毒性剂量剔除标准,即Pr>Pe(真毒性概率>目标毒性概率的概率>Pe),一般我们把Pe设置为0.95。对于低剂量组的毒性被认为是显著的药物来说,可以选择使用更加严格的剔除标准,避免首个剂量组已经超过MTD。另一方面,我们也可以选择确保MTD下的DLT概率小于我们的剂量降低界值,这一选项会提高试验的安全性,但是可能会稍微降低MTD的选择比例(selection percentage)。


全部设置完后,即可获得设计的流程图及决策表





如果选择了更加严格的第一剂量组剔除规则的话,还会得到一个试验终止决策表:


2、Simulation选项卡

我们还可以通过Simulation选项卡,模拟在不同“真”毒性概率下的试验参数,并且我们可以同时模拟3+3设计下MTD组入组人数及选择比例与BOIN设计的差异,更加直观的了解两者的差异性。网站基于前面填入的目标毒性概率会自动随机生成5个不同的“真”毒性概率情景,我们也可以手动更改。

模拟结束后,我们可以得到如下的表格供参考。


完成上面两个选项卡的操作后,网站在Trial Protocol选项卡中提供了自动生成的试验方案模板和流程图供参考。

3、Select MTD选项卡

当试验全部完成后,我们可以通过Select MTD选项卡,输入我们试验获得的数据,从而得到一个不同剂量水平下MTD的选择概率。如下图所示,第三剂量水平的DLT概率最为接近我们的目标毒性概率,故MTD为第三剂量水平。


此工具还有桌面软件的版本,与在线版几乎一致,由于软件可及性的问题,建议使用在线版本。

方法二

使用R语言(适合专业用户)

考虑到使用R语言的门槛。此处仅为简要介绍。

在R中使用BOIN设计需要首先获得并引用资源包


第一步获得递增减少界值,我们可以利用 get.boundary()函数


举个例子比如


第二步我们可以像在网上操作那样,通过模拟预测试验的一些参数,使用get.oc()函数。


可以发现许多参数与上面的get.boundary()类似,这里不再多说,仅介绍下特有的参数:


同时我们也可以使用summary()或plot()去获得和网页版类似的表格和图表。

当完成试验后,可以通过select.mtd选择我们的MTD:



与上面类似,可使用summary()或plot()去获得和网页版类似的表格和图表。

BOIN资源包中同时也包括了设计BOIN comb的函数。使用R进行操作可能会增加难度,但对于有经验的R语言用户来说,这种方法可以与其他R资源包结合,使得整个操作过程更加的灵活。加小编微信讨论或获取BOIN资源包手册。

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